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迪士尼彩乐园哪个是真 海洋所海藻种质库团队发布海带高质地染色体水平参考基因组

发布日期:2024-08-17 18:54    点击次数:99

2月18日,中国科学院海洋辩论所海藻种质库团队(www.caslivealgae.com)在大型海藻基因组学辩论方面取得要紧冲破迪士尼彩乐园哪个是真,生效构建了海带(Saccharinajaponica)的高质地染色体水平参考基因组。该后果以"Chromosome-levelgenomeassemblyfortheecologicallyandeconomicallyimportantalgaSaccharinajaponica"为题发表在外洋期刊ScientificData(Q1,IF=5.8)。这是该团队在海洋经济藻类基因组辩论边界取得的又一要紧后果,为海带的遗传矫正和基因组学辩论提供了要害资源。

海带是北太平洋西北沿岸的要紧大型褐藻,鄙俗散播于中国、俄罗斯、日本和韩国等地。动作群众海藻衍坐褥量最高的种类,海带在生态和经济上具有要紧价值。2020年,海带的鲜重产量达到1086万吨,市集价值跨越44亿好意思元。尽管传统的采纳育种和杂交时刻已培育出多个优良品种,高质地的染色体水平基因组拼装关于进一步的遗传矫正还是伏击。

海带富含藻酸盐等多糖类物资,使得DNA的索乞降纯化十分费事,进而影响测序质地和后续的拼装责任。此前,由于测序和拼装时刻的甩掉,已公布的海带基因组存在严重的片断化问题,制约了分子育种和基因组学辩论的长远开展。这次,辩论团队空洞给与运用Illumina测序、PacBio测序和Hi-C援手基因组拼装时刻,生效构建了海带雌性孢子体的高质地染色体水平基因组。该基因组大小为516.11Mb,contigN50长度为491.30Kb,迪士尼彩乐园scaffoldN50长度为16.24Mb,共挂载到32条染色体。类似序列占基因组的45.07%,共估计到17,739个卵白编码基因,其中82%赢得了功能提神。该基因组的构建为海带的分子育种、生物时刻应用以及褐藻的生态和进化辩论提供了要紧基础。值得一提的是,辩论团队在测序材料的采纳上好意思满了要紧翻新——运用孤雌生殖时刻培育了纯合二倍体的雌性孢子体动作测序样本,幸免了异源性对基因组拼装的骚扰,进一步培育了基因组数据的准确性和可靠性。

海带孤雌生殖孢子体基因组拼装

本形态由水产物种质创制与高效衍生重心试验室逄少军辩论团队与海洋生态与环境科学重心试验室刘进贤团队共同完成,李晓东助理辩论员为第一作家,逄少军辩论员为通信作家,中国科学院海洋辩论所为第一完成单元。

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辩论得到了国度重心研发谈判后生科学家形态、泰山产业领军东说念主才蓝色东说念主才专项、福建省海洋生物增衍生与高值化运用重心试验室灵通课题等项筹画资助。大连海宝渔业股份有限公司冷晓飞高等工程师和张明付协助了本形态中测序样本配子体的汇注和储藏责任。

论文信息:

Li,X.迪士尼彩乐园哪个是真,Li,YL.,Zhong,C.etal.Chromosome-levelgenomeassemblyfortheecologicallyandeconomicallyimportantalgaSaccharinajaponica.SciData12,290(2025).https://doi.org/10.1038/s41597-025-04620-w



 




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